序列比对工具

发布时间：2024-03-15 17:31
下面围绕“序列比对工具”主题解决网友的困惑

双序列比对工具

EMBI 的在线双序列比对工具提供了三种选项，1）全局比对；2）局部比对；3）全基因组比对。并且每一个比对工具下提供了不同算法的选择。这里我使用的uniprot 中的AB...

详细介绍双序列比对、blast 以及多序列比对的区别,

BLAST是一种启发式算法,用于在大型数据库中寻找比对序列,是一种在局部比对基础上的近似比对算法,可以在保持较高精度的情况下大大减少程序运行的时间。算法思想描述...

快速修剪-多序列比对结果-构建靠谱的进化树

于是，现在TBtools中存在 三个多序列比对结果的修剪逻辑 。从图片上来看，这三个功能都只是 输入的多序列比对结果 输出的剪切后的结果 并没有太多需要说的。我也不...

列举常用的生物信息学数据库及序列对比常用软件及特

一般来说所用的分析工具有在线跟下载的 下面简要列举一些常用在线软件的使用 1、使用VecScreen工具，分析下列未知序列，输出序列长度、载体序列的区域、可能使用的...

我从网上NCBI上找到某个基因的MRNA序列,利用什么软

根据约定，所有的序列都是按照5'-3'的方向书写，所以cDNA序列应该是mRNA序列的互补，翻转序列，也就是Reverse Complement。如果你用“Reverse Complement of Seque...

16个常用生物信息在线工具

工具：Cap3 地址： http://doua.prabi.fr/software/cap3 多序列比对相似性展示 工具：SimiTriX-SimiTetra 地址： http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/sim...

多个Sanger测序结果和多序列比对结果的可视化

主要原因是，没有可视化结果，那么其实即使比对出来，也不容易做数据观测。 于是我加了一个自动展示多序列比对结果的功能。 首先是打开这个Wrapper 写工具，终...

序列比对软件 MUMmer 结果可读化处理(四)

输出文件的格式与输入文件相同，详见： 序列比对软件 MUMmer 结果文件解读（三）可以展示命令行上两个特定序列的 pair-wise alignment，便于识别错误的确切位置以...

blastp、blastx、tblastn和tblastx子工具的用途

BLAST套件的blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx子工具的用途分别如下：1、blastn是将给定的核酸序列与核酸数...

RNAseq-踩坑02- Aligment 比对率低

这就需要借助于工具查看了。基本命令 samtools view [options] <输入bam文件> bam/sam文件 每一列的内容 fastq文件格式 FASTQ文件中每个序列通常有四行：fast...

网站已经找到数个序列比对工具的检索结果

更多有用的内容，可前往注册码注册查询系统主页查看

返回顶部